پژوهشکده بيوتکنولوژي پژوهشگاه رويان در سال 1383 به همت مرحوم دکتر کاظمي آشتياني در اصفهان تأسيس شد و با همت عالي پژوهشگران جوان اين پژوهشکده اولين پستاندار شبيه سازي شده خاورميانه در سال 85 در اين مجموعه متولد شد که اين دستاورد، کشورمان را در زمره معدود کشورهاي صاحب نام در زمينه دانش بيوتکنولوژي قرار داد و دستمايه حرکت مهم پژوهشگاه رويان براي توليد حيوانات تراريخت قرار گرفت.

دستاورد اخير اين پژوهشکده در زمينه توليد حيواناتي که در شير آنها پروتيين موسوم به TPA جهت رفع لخته هاي خون در جلوگيري يا کاهش سکته هاي قلبي و مغزي و نيز فاکتور 9 براي درمان بيماريهاي مانع انعقاد خون وجود دارد، نقطه عطفي در صنعت دارو سازي کشور است که باعث رفع وابستگي کشور و به ويژه تأمين نياز بيماران نيازمند داروهاي خاص مي‌شود.

پژوهشگاه رويان در حال حاضر يک چرخه کامل توانمند را ايجاد نموده که قادر است هر نوع پروتيين دارويي مد نظر صنعت دارويي کشور را در کمتر از 2 سال در شير حيوانات تراريخت توليد نمايد و با حمايت مسئولان کشور اميدوار است آخرين حلقه اين توانمندي که استخراج اين دسته پروتيين ها از شير و ورود آنها به سبد دارويي کشور است در آينده نزديک محقق شود.

فناوري ديگري که امروز پروژه عملياتي کردن آن با حضور دکتر احمدي نژاد آغاز مي‌شود فعاليتي است که در نوع خود در دنيا منحصر به فرد بوده و تحقق آن مي‌تواند بهترين مدعا بر توانمندي علمي کشورمان در عرصه پزشکي مدرن باشد. پروژه توليد اعضاي حياتي مورد نياز پيوند عضو از مهمترين پروژه‌هاي مدنظر پژوهشکده بيوتکنولوژي پژوهشگاه رويان است که امروز با حضور رييس جمهور آغاز به کار مي کند و از کاربرد بسيار بالايي در رفع يکي از بغرنج¬ترين مشکلات سلامت کشور برخوردار است.

در حال حاضر يکي از معضلات سلامت هر فرد خطر از کار افتادن زود رس يا نارسايي ارگانهاي حساس بدن مثل کبد، کليه، لوزالمعده، قلب و ساير اعضاست که نه تنها زندگي فرد را به مخاطره مي‌اندازد بلکه خانواده وي و جامعه را نيز متحمل خسارات هنگفت اقتصادي و رواني ميکند. با وجود اينکه امروز کشورمان از کشورهاي پيشرو در زمينه پيوند اعضا مي باشد، با اين وجود در حال حاضر تنها راه دستيابي به اعضاي پيوندي استفاده از اعضاي افراد مبتلا به مرگ مغزي است که با مشکلات عديده‌اي ناشي از کمبود منابع اينگونه پيوندهاي اعضا و مهمتر از آن مسائل حاد مربوط به رد پيوند مواجه است. در فناوري جديد پژوهشکده بيوتکنولوژي رويان با استفاده از مهندسي ژنتيک ژن مسئول توليد يک ارگان خاص حيوان به عنوان مثال کبد يا قلب در جنين حيوان حذف شده و سپس سلولهاي بنيادي بيمار نيازمند به پيوند عضو در آزمايشگاه توليد و در کنار جنين حيوان قرار مي گيرد تا جنين با استفاده از سلولهاي بنيادي بيمار نيازمند عضو مورد نظر را در بدن خود توليد کند و سپس به راحتي مي‌توان عضو توليد شده را که کاملا داراي منشأ انساني است و قابل پيوند به بيمار مورد نظر مي‌باشد به بيمار پيوند زد.